Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR1CO15160 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms