Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK1O15075 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLK1O15075 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms