Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF6O14896 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF6O14896 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF6O14896 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF6O14896 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF6O14896 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF6O14896 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF6O14896 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF6O14896 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF6O14896 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF6O14896 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF6O14896 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms