Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CITO14578 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CITO14578 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CITO14578 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CITO14578 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CITO14578 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CITO14578 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CITO14578 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CITO14578 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CITO14578 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms