Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN5O00501 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN5O00501 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN5O00501 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms