Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SUPT5HO00267 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SUPT5HO00267 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SUPT5HO00267 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms