Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
I3L3M4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
I3L3M4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
I3L3M4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
I3L3M4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
I3L3M4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
I3L3M4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
I3L3M4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms