Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MCRIP1C9JLW8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms