Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
USP17L13C9JLJ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms