Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIGD1CA8MV81 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms