Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP17L5A8MUK1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP17L5A8MUK1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms