Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CYSRT1A8MQ03 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYSRT1A8MQ03 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms