Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDR42E2A6NKP2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDR42E2A6NKP2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms