Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6L9A6NEM1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6L9A6NEM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms