Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GOLGA6BA6NDN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6BA6NDN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms