Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6CA6NDK9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms