Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PSDA5PKW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PSDA5PKW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms