Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMB4A4D0S4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LAMB4A4D0S4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LAMB4A4D0S4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms