Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SBNO1A3KN83 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SBNO1A3KN83 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms