Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf170A2RU37 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms