Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0U1RQF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0U1RQF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms