Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
A0A0D9SFI3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A0D9SFI3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms