Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB6Q9Y5E3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB6Q9Y5E3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms