Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HES2Q9Y543 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HES2Q9Y543 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms