Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HECTD4Q9Y4D8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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