Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3BP1Q9Y3L3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3BP1Q9Y3L3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms