Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9Y3F1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9Y3F1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9Y3F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q9Y3F1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q9Y3F1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms