Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP3Q9Y2W7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms