Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms