Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NUDCQ9Y266 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUDCQ9Y266 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms