Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POMPQ9Y244 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POMPQ9Y244 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms