Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD1Q9Y239 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NOD1Q9Y239 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms