Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVW-1Q9UQF0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVW-1Q9UQF0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms