Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGSF9BQ9UPX0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGSF9BQ9UPX0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms