Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PHF8Q9UPP1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms