Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4E1Q9UPM8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms