Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TTF2Q9UNY4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TTF2Q9UNY4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms