Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CAPN11Q9UMQ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms