Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNMA8BQ9ULN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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