Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED23Q9ULK4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MED23Q9ULK4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms