Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH9Q9ULB4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms