Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MKLN1Q9UL63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MKLN1Q9UL63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms