Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3Q9UKS6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms