Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GGA1Q9UJY5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GGA1Q9UJY5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GGA1Q9UJY5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms