Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGA2Q9UJY4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GGA2Q9UJY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms