Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDC23Q9UJX2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms