Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SIX4Q9UIU6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms