Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SCOCQ9UIL1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms