Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUF60Q9UHX1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PUF60Q9UHX1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms