Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GPN3Q9UHW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms